Macro-atividade #273

Atividade 2: Desenvolvimento de ambientes de SaaS específicos na UFBA

Adicionado por Antônio Tadeu Azevedo Gomes mais de 4 anos atrás. Atualizado almost 4 years atrás.

Situação:Em andamento Início:07/03/2013
Prioridade:Normal Data prevista:30/10/2013
Atribuído para:Felipe Gutierrez % Terminado:

100%

Categoria:- Tempo gasto: 70.00 horas
Versão:- Tempo estimado:40.00 horas

Descrição

Esta atividade contempla a divulgação da plataforma mc2 junto a potenciais usuários na UFBA, com o objetivo de identificar aplicações que possam ser executadas na plataforma mc2. Identificadas essas aplicações, as mesmas serão utilizadas para a configuração de ambientes de SaaS customizados que facilitem a utilização da aplicação por seus usuários.

Histórico

Atualizado por Marcos Barretomais de 4 anos

  • Início ajustado para 21/02/2013
  • % Terminado alterado de 0 para 20

1. Contato com pesquisadores e professores dos Institutos de Física (IF) e de Humanidades, Artes e Ciências (IHAC) para captação de aplicações
2. Em 21/02/2013: apresentação da arquitetura mc² para alunos e professores da pós-graduação em Computação.

Atualizado por Marcos Barretomais de 4 anos

  • Data prevista ajustado para 15/03/2013
  • Início alterado de 21/02/2013 para 07/03/2013
  • % Terminado alterado de 20 para 30

1. Implementação do portal mc^2 para o Hex usando BOINC como infra de execução.

Atualizado por Felipe Gutierrezmais de 4 anos

  • % Terminado alterado de 30 para 80

Realizado o desenvolvimento de outras aplicações e-science para o Boinc e integração com o CSGrid. Além da aplicação Hex foram feitos testes com um programa em C++ de ordenamento de números e um benchmark NAS escrito em Fortran disponível em https://www.nas.nasa.gov/cgi-bin/software/start.
O próximo passo é inserir mais clientes Boinc no sistema e realizar métricas relevantes para a análise.

Atualizado por Felipe Gutierrezmais de 4 anos

Realizado o desenvolvimento de aplicações para o Boinc e integração com o CSGrid. Além da aplicação Hex (protein docking), foram feitos testes com um benchmark NAS escrito em Fortran disponível em https://www.nas.nasa.gov/cgi-bin/software/start. O próximo passo é inserir mais clientes Boinc no sistema e desenvolver outras aplicações científicas, já em prospecção junto a usuários interessados.

Atualizado por Antônio Tadeu Azevedo Gomesmais de 4 anos

  • Situação alterado de Nova para Em andamento

Atualizado por Antônio Tadeu Azevedo Gomesmais de 4 anos

  • Data prevista alterado de 15/03/2013 para 30/10/2013

Atualizado por Felipe Gutierrezmais de 4 anos

Contato com pesquisadores do Instituto de Biologia para adaptação de aplicações de simulação de genética de populações para a plataforma MC2.

Atualizado por Felipe Gutierrezaproximadamente 4 anos

  • % Terminado alterado de 80 para 90

Foi implantada a aplicação científica MEGA (http://www.megasoftware.net/) no BOINC. Essa aplicação é utilizada no Instituto de Biologia na UFBA. Ela está disponível apenas para windows e MacOS. A verão implatada é executada em plataformas Windows Intel x86. Um pequeno tutorial de sua instalação está disponível em https://sites.google.com/site/lipe82/Home/diaadia/mega. O tempo gasto para sua instalação foi um pouco longo pois o componente wrapper disponibilizado no site do BOINC estava com erro para a versão windows. Depois de algumas trocas de mensagens com os desenvolvedores do BOINC, foi encontrada uma solução.

Atualizado por Felipe Gutierrezaproximadamente 4 anos

Atualizada a instalaçaõ do MEGA no BOINC para mais arquivos de entrada e de saída: https://sites.google.com/site/lipe82/Home/diaadia/mega
Construído o script do SGA-BOINC para o MEGa de acordo com o padrão do OurGrid: https://sites.google.com/site/lipe82/Home/diaadia/mega-csgrid

Atualizado por Felipe Gutierrezaproximadamente 4 anos

  • Tempo estimado ajustado para 40.00

Atualizada a instalação do MEGA no BOINC para mais arquivos de entrada e de saída: https://sites.google.com/site/lipe82/Home/diaadia/mega
Construído o script do SGA-BOINC para o MEGA de acordo com o padrão do OurGrid: https://sites.google.com/site/lipe82/Home/diaadia/mega-csgrid
A próxima etapa é configurá-lo com o PortalEngin.

Atualizado por Felipe Gutierrezalmost 4 years

  • % Terminado alterado de 90 para 100

Foram feitos testes com o SGA-BOINC para o MEGA-CC com sucesso. A partir desta implementação foi desenvolvido um SGA-Hadoop para dois tipos de aplicações. Uma aplicação de procura de strings em arquivos e a aplicação científica CloudBurst (http://sourceforge.net/apps/mediawiki/cloudburst-bio/index.php?title=CloudBurst).
A integração SGA-BOINC via PortEngine está sendo validada pelo grupo da UFCG a partir das fontes de documentação das tarefas anteriores.

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