Macro-atividade #275

Atividade 4: Desenvolvimento de ambientes de SaaS específicos no CESUP/UFRGS

Adicionado por Antônio Tadeu Azevedo Gomes mais de 4 anos atrás. Atualizado mais de 3 anos atrás.

Situação:Em andamento Início:25/02/2013
Prioridade:Normal Data prevista:30/10/2013
Atribuído para:Glaucio Souza % Terminado:

100%

Categoria:- Tempo gasto: -
Versão:-

Descrição

Esta atividade contempla a divulgação da plataforma mc2 junto a potenciais usuários no CESUP/UFRGS, com o objetivo de identificar aplicações que possam ser executadas na plataforma mc2. Identificadas essas aplicações, as mesmas serão utilizadas para a configuração de ambientes de SaaS customizados que facilitem a utilização da aplicação por seus usuários.

Histórico

Atualizado por Glaucio Souzamais de 4 anos

  • Data prevista ajustado para 30/10/2013
  • Início ajustado para 25/02/2013
  • % Terminado alterado de 0 para 20
  1. 04/03/2013: Definida relação de aplicações utilizadas no CESUP/UFRGS
  2. 05/04/2013: Realizado treinamento remoto Grade PADBR e Plataforma mc2
  3. 08/04/2013: Reunião Técnica dos CENAPADs

Atualizado por Glaucio Souzamais de 4 anos

  1. Selecionado o pacote GROMACS para ser utilizado em ambiente SaaS na plataforma mc2
  2. Contato com usuários do GROMACS no CESUP para coleta de informações
Em andamento:
  1. Estudo das informações coletadas de usuários do CESUP para implementar portal GROMACS

Atualizado por Antônio Tadeu Azevedo Gomesmais de 4 anos

  • Situação alterado de Nova para Em andamento

Atualizado por Glaucio Souzamais de 4 anos

  • % Terminado alterado de 20 para 30
  1. Gerados os arquivos de configuração e script de chamada de execução do binário da aplicação que serão utilizados na implementação do portal
  2. Gerados os arquivos necessários para execução de uma simulação GROMACS
  3. Simulação GROMACS testada em ambiente de linha de comando para servir de parâmetro na execução de testes iniciais no portal

Em andamento:

  1. Instalação do algoritmo no servidor CSGrid de produção
  2. Construção do portal GROMACS

Atualizado por Glaucio Souzamais de 4 anos

  • % Terminado alterado de 30 para 40
  1. Algoritmo GROMACS instalado no servidor CSGrid de produção
  2. Testes do algoritmo foram realizados com sucesso no cluster gauss do CESUP
  3. Testes do algoritmo no cluster fermi do CESUP em espera devido à grande carga no cluster
Em andamento:
  1. Construção do portal GROMACS

Atualizado por Glaucio Souzamais de 4 anos

  • % Terminado alterado de 40 para 50
  1. O portal GROMACS foi gerado utilizando o PortEditor e colocado em produção

Em andamento:

  1. Testes com o portal e estudos dos ajustes necessários

Atualizado por Glaucio Souzaaproximadamente 4 anos

  • % Terminado alterado de 50 para 60
  1. Foram realizados testes bem sucedidos do portal GROMACS tanto no modo de usuário cadastrado como com usuário convidado
  2. Foi adicionada uma nova versão do algoritmo fixando o número de núcleos de processamento disponibilizados para cada job
Em andamento:
  1. Divulgação do portal para alguns usuários selecionados testarem as funcionalidades existentes
  2. Analisar avaliação dos usuários buscando a melhoria do portal
  3. Selecionar e implementar modificações sugeridas
  4. Restringir mais o acesso aos recursos computacionais disponibilizados para os usuários convidados

Atualizado por Glaucio Souzaalmost 4 years

  • % Terminado alterado de 60 para 80
Em andamento:
  1. Usuários realizando testes no portal
Próximos passos:
  1. Realização de seminário para grupo de pesquisa apresentando os serviços disponíveis na plataforma MCC
  2. Analisar avaliação dos usuários buscando a melhoria do portal
  3. Selecionar e implementar modificações sugeridas
  4. Restringir mais o acesso aos recursos computacionais disponibilizados para os usuários convidados

Atualizado por Glaucio Souzaalmost 4 years

  1. Foi realizado um seminário para um grupo de pesquisa em bioinformática apresentando os serviços disponíveis na plataforma MCC. O grupo em questão está utilizando experimentalmente o portal GROMACS buscando identificar e sugerir modificações necessárias
  2. Os usuários experimentais sugeriram algumas modificações na plataforma e no algoritmo, de forma a facilitar o uso do portal e fornecer algumas funcionalidades que o GROMACS já oferece por linha de comando
Em andamento:
  1. As sugestões dos usuários estão sendo implementadas
  2. As restrições ao acesso para os usuários convidados serão implementadas junto a implementação das sugestões dos usuários

Atualizado por Glaucio Souzaalmost 4 years

  • % Terminado alterado de 80 para 90

Atualizado por Glaucio Souzamais de 3 anos

  • % Terminado alterado de 90 para 100
  • Foi criado um novo algoritmo que contempla a possibilidade de uso do arquivo de checkpoint do GROMACS de forma que o usuário possa iniciar uma simulação a partir de um ponto de parada anterior.
  • Embora o portal forneça funcionalidades básicas para uma simulação GROMACS, possibilitando a execução da parte principal de uma simulação, ainda existem uma grande variedade de outras ferramentas do pacote que podem ser implementadas. O portal oferece os recursos necessários para a implementação de tais ferramentas, sendo necessário o estudo para definir quais são viáveis e qual a melhor forma de desenvolver seus algoritmos.
  • O portal foi considerado muito útil, funcional e amigável pelos usuários que realizaram os testes. Tal plataforma é considerada de grande valor para o avanço de pesquisas que necessitem de poder computacional, cumprindo seu papel de facilitadora na execução de simulações científicas.
  • Estão em andamento colaborações entre o CESUP e os usuários que testaram a plataforma buscando a melhoraria da mesma e identificar novas possibilidades de uso do que ela oferece.

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